Retrotranspozon temelli moleküler belirteçler kullanılarak Türk arpa (Hordeum vulgare L.) çeşitlerinin genomik karakterizasyonu

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorSipahi, Hülya
dc.contributor.authorYumurtacı, Ayşen
dc.date.accessioned2025-03-23T19:09:54Z
dc.date.available2025-03-23T19:09:54Z
dc.date.issued2020
dc.departmentSinop Üniversitesi
dc.description.abstractKökeni Doğu Akdeniz ülkelerine dayanan, hayvan yemi ve maltlık olarak tüketilen arpanın,dünyanın birçok bölgesinde tarımı ve ıslahı yapılmaktadır. Arpa çeşitlerinde genetikçeşitliliğin belirlenmesi, çeşitler arasındaki genetik ilişkilerin ortaya çıkarılması ve ıslahçıhaklarının korunması için moleküler yöntemlerden faydalanılmaktadır. Bu çalışmada, arpagenomunun önemli bileşenlerinden olan BARE-1 retrotranspozonu ile ilişkili IRAP(Retrotranspozon-arası Çoğaltılmış Polimorfizm), REMAP (Retrotranspozon-MikrosatellitÇoğaltılmış Polimorfizmi) ve iPBS (Primer Arası Bağlanma Yeri Polimorfizmi) olarakadlandırılan moleküler belirteçler kullanılarak ulusal birçok çeşidin karakterizasyonuyapılmıştır. Toplamda 211 alel olmak üzere, 3 IRAP primer çifti 49.5 REMAP primer çifti 55ve 7 iPBS primer çifti için 107 alel tespit edilmiştir. Lokus başına ortalama 14 alelbelirlenmiştir. Polimorfik Bilgi İçeriği (PIC) ortalama değeri REMAP için 0.407, IRAP için0.454 ve IPBS için de 0.442 bulunmuştur. Genetik benzerlik değerleri 0.41 ila 0.93 arasındadeğişmiştir. Tüm belirteçler için ortalama fark yöntemi (UPGMA) kümeleme analiziyapılarak, çeşitler genetik benzerliklerine göre gruplandırılmışlardır. Bu çalışmada, fazlasayıda alel ve yüksek PIC değeri vermeleri, ucuz ve kolay elde edinimleri nedeniyle,transposon temelli moleküler belirteçler ile çok yakın ilişkili çeşitlerin dahi ayrımının kolaybir şekilde yapılabileceği görülmüştür. Transposon esaslı belirteçler, çeşitler arasında genetikilişkileri belirlemenin yanı sıra genetik kaynakların korunmasında ve tohum bankalarınınyönetiminde faydalı olabilecektir.
dc.identifier.doi10.29136/mediterranean.690224
dc.identifier.endpage283
dc.identifier.issn2528-9675
dc.identifier.issue2
dc.identifier.startpage275
dc.identifier.trdizinid397921
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.29136/mediterranean.690224
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/397921
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11486/3481
dc.identifier.volume33
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.ispartofMediterranean Agricultural Sciences
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_TR_20250323
dc.subjectBiyoloji
dc.subjectGenetik ve Kalıtım
dc.subjectZooloji
dc.titleRetrotranspozon temelli moleküler belirteçler kullanılarak Türk arpa (Hordeum vulgare L.) çeşitlerinin genomik karakterizasyonu
dc.typeArticle

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu