Characterization of Bacillus species by numerical analysis of their SDS-PAGE protein profiles

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorBerber, İsmet
dc.date.accessioned2014-08-14T08:10:57Z
dc.date.available2014-08-14T08:10:57Z
dc.date.issued2004
dc.description.abstractIn the present study nine reference Bacillus strains were characterized by whole-cell protein profiles using sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). A numerical classification of the protein profiles revealed two distinct clusters at 47% similarity level. Cluster 1 comprised four strains belongs to B. subtilis and B. megaterium species at similarity levels changed between 67 and 85%, while cluster 2 consisted five strains belongs to various Bacillus species at similarity levels changed between 50 and 70%. The strains of the cluster 2 were clearly separated from that of cluster 1 by numerical analysis. Our results indicates that SDS-PAGE method combined with computerized analysis of cellular protein profiles provide an effective approach to investigate of taxonomic relationships within Bacillus species.
dc.description.abstractBu çalışmada, dokuz referans Bacillus ırkı sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi kullanılarak elde edilen toplam hücresel protein profillerine göre karakterize edildi. Protein profil sonuçları esas alınarak yapılan nümerik sınıflandırma %47 benzerlik düzeyinde iki ayrı grup (cluster) oluşturdu. Grup 1 benzerlik düzeyi %67-85 arasında değişen B. subtilis ve B. megaterium türlerine ait dört ırkı; grup 2 benzerlik seviyesi % 50-70 arasında değişen farklı Bacillus türlerine ait beş ırkı içermektedir. Nümerik analizde grup 1’e ait ırklar grup 2’den açıkça ayrılmaktaydı. Bizim sonuçlarımız, SDS-PAGE yöntemiyle elde edilen hücresel protein profillerinin bilgisayar analizleriyle birleştirilmesinin Bacillus türlerinin taksonomik ilişkilerinin incelenmesinde etkili bir yaklaşım sağladığını gösterdi.
dc.identifier.citationBerber, İ., "Characterization of Bacillus species by numerical analysis of their SDS-PAGE protein profiles". Journal of Cell and Molecular Biology, 3: 33-37, 2004.
dc.identifier.urihttp://jcmb.halic.edu.tr/pdf/3-1/Characterization.pdf
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11486/322
dc.institutionauthorBerber, İsmet
dc.language.isoen
dc.publisherJournal of Cell and Molecular Biology
dc.relation.publicationcategoryMakale - Kategorisiz
dc.subjectCharacterization
dc.subjectBacillus
dc.subjectSDS-PAGE
dc.subjectNumerical taxonomy
dc.subjectKarakterizasyon
dc.subjectNümerik taksonomi
dc.titleCharacterization of Bacillus species by numerical analysis of their SDS-PAGE protein profiles
dc.title.alternativeBacillus türlerinin SDS-PAGE protein profillerinin nümerik analizle karakterizasyonu
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Characterization of Bacillus species by numerical analysis of their SDS- Page protein profiles.pdf
Boyut:
135.65 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale Dosyası
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
[ X ]
İsim:
license.txt
Boyut:
1.71 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Makale Koeksiyonu