Yazar "Sipahi, Hülya" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 6 / 6
  • Küçük Resim
    Öğe
    Arpada (Hordeum vulgare L.) Depo Proteini Elektroforegramlarının Malt Kalitesi ile İlişkisinin Belirlenmesi
    (Tarla Bitkileri Merkez Araştırma Enstitüsü Dergisi, 2009) Sipahi, Hülya; Akar, Taner; Özkara, Recep; Yıldız, Mehmet Ali; Başpınar, Ensar; Sayım, İsmail
    Tohum depo proteinin (hordein) elektroforetik bant ve bant modellerinin malt kalite kriterleri ile ilişkisi, 28 arpa çeşidi (Hordeum vulgare) kullanılarak araştırılmıştır. Çeşitlerde 19 farklı bant modeli ve bu modellerde 45 adet bant saptanmıştır. Malt kalite kriterleri yönünden yapılan analizlerde, çeşitlerin her bir kriter bakımından önemli farklılıklar gösterdikleri tespit edilmiştir (p<0.01). Farklı hordein bant modellerine sahip bazı çeşitlerin belirli malt kalite kriterleri ortalamaları arasındaki farkları önemli olmadığı belirlenmiştir (p<0.05). Malt kalitesini etkileyen belirli özellikler bakımından yapılan kümeleme analizi sonuçlarından, farklı hordein bant modellerine sahip çeşitlerin aynı kümede, benzer hordein bant modeline sahip olanların ise farklı kümelerde yer alabildikleri görülmüştür. Bu durumda genel olarak, hordein bant modelleri ile malt kalitesi arasında herhangi bir ilişkinin bulunmadığı söylenebilinir. Her bir hordein bandının malt kalite kriterleri ile olan ilişkisi ise, söz konusu banda sahip olan ve olmayan çeşitlerin ele alınan özellik ortalamaları arasındaki farkların irdelenmesi ile tespit edilmiştir. Rutubet ile 3, özüt ile 8, çözünür azot ile 9, Kolbach indeksi ile 3, vizkozite ile 20, friabilite ile 19, protein ile 11 tane hordein bandına sahip olan çeşitler ile olmayan çeşitlerin ortalamaları arasındaki farklar istatistik olarak önemli bulunmuştur (p<0.05). Buna dayanarak bazı hordein bantlarının malt kalitesinin düşük veya yüksek olmasının bir göstergesi olarak kullanılabileceği ifade edilebilir.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Determination of genetic variation and relationship in Turkish barley cultivars by hordein and RAPD markers
    (Turkish Journal of Field Crops, 2010) Sipahi, Hülya; Akar, Taner; Yıldız, Mehmet Ali; Sayım, İsmail
    Genetic variation and relationships among thirty four barley cultivars (H. vulgareL.) improved in Turkey were assessed by hordeins and RAPDs. Totally, 15 different hordein patterns were observed among 34 cultivars and twelve of these were cultivar specific. In comparison to hordeins, the RAPD variation observed among cultivars was higher and 80 % of these scorable bands were polymorphic. Genetic similarity (GS) calculated on hordein and RAPD data ranged from 0.52 to 1.00 and 0.57 to 1.00, respectively. Cluster analyses based on hordein data showed that most of the cultivars are closely related in genetical point of view. The dendrogram of hordeins were completely different from those of RAPDs and they couldn’t precisely separate the barley cultivars. In addition to these, the level of polymorphism detected with hordein was lower than that of with RAPDs. Correspondence analysis by using two marker systems showed that RAPD data could distinguish almost all barley cultivars except Tokak 157/37 and Bülbül89, whereas hordein data were not able to perform to distinguish barley cultivars like RAPDs. Some polymorphic and repeatable RAPDs markers should be equipped with morphologic markers in order to identify candidate cultivars and registered cultivars before and after registration procedure.
  • [ X ]
    Öğe
    Dissection of Barley Landraces Originated From Twelve Different Countries by Using Simple Sequence Repeats Markers
    (2015) Sipahi, Hülya; Yumurtaci, Aysen
    Genetik çeşitliliğin önemli bir kaynağı olan yerel çeşitler, tahıl türlerinin geliştirilmesi için önemlidirler. Yerel çeşitler arasındaki genetik çeşitliliğin araştırılması, genetik kaynakları koruma ve arpa ıslahında gelecek stratejileri geliştirme için önemlidir. Bu çalışmada, on iki ülkeden köken alan arpa yerel çeşitlerindeki genetik çeşitlilik, basit sıra tekrarları (BST) işaretleyicileri kullanılarak çalışılmıştır. Yedi arpa bağlantı grubuna ait onaltı BST işaretleyicisi yüksek genetik çeşitliği ortaya çıkarmıştır. Toplamda 92 polimorfik allel sayılmış ve allel sayısı 5.75 ortalama ile lokus başına 1 ila 7 arasında olmuştur. Genetik çeşitlilik en yüksek Türkiye yerel çeşitlerinde (0.66 0.13), en düşük Ukrayna yerel çeşitlerinde (0.38 0.24) belirlenmiştir. Polimorfik lokus yüzdesi, Almanya, Holanda, Rusya, Türkiye ve Amerikada en yüksek yani % 100 iken, % 75 ile en düşük İngilterede bulunmuştur. Yerel çeşitlerin kümeleme analizleri onları dört ana gruba ayırmıştır. Sonuçlar gelecekteki ıslah çalışmaları için farklı ülkelerden arpa yerel çeşitleri hakkında ilave genetik bilgiler sağlamıştır. Anahtar Kelimeler: Arpa; Yerel çeşitler; BST; Çeşitlilik
  • Küçük Resim
    Öğe
    Genetic screening of Turkish barley genotypes using simple sequence repeat markers
    (Journal of Cell and Molecular Biology, 2011) Sipahi, Hülya
    Thirty-four Turkish barley genotypes were differentiated and identified using barley simple sequence repeat (SSR) markers. Amplification of SSR loci were generated using 17 SSR primers. These SSR primers totally produced 67 alleles ranging from two to six alleles per locus with a mean value of 3.94 alleles per locus. Genetic similarity ranged from 0.507 to 1.000. Maximum genetic similarity was found between Efes-98-Başgül, and among Anadolu-86, Obruk-86, Anadolu-98, Tokak157/37 and Orza-96. Minimum genetic similarity was between Bolayır and Angora. Although SSR markers cannot classify 34 Turkish barley cultivars based on end use, growth habits and row groups, 27 Turkish barley genotypes could be identified uniquely using 17 SSR primers. These results will are useful proves for protecting breeder’s rights and designing new crossings.
  • [ X ]
    Öğe
    Retrotranspozon temelli moleküler belirteçler kullanılarak Türk arpa (Hordeum vulgare L.) çeşitlerinin genomik karakterizasyonu
    (2020) Sipahi, Hülya; Yumurtacı, Ayşen
    Kökeni Doğu Akdeniz ülkelerine dayanan, hayvan yemi ve maltlık olarak tüketilen arpanın,dünyanın birçok bölgesinde tarımı ve ıslahı yapılmaktadır. Arpa çeşitlerinde genetikçeşitliliğin belirlenmesi, çeşitler arasındaki genetik ilişkilerin ortaya çıkarılması ve ıslahçıhaklarının korunması için moleküler yöntemlerden faydalanılmaktadır. Bu çalışmada, arpagenomunun önemli bileşenlerinden olan BARE-1 retrotranspozonu ile ilişkili IRAP(Retrotranspozon-arası Çoğaltılmış Polimorfizm), REMAP (Retrotranspozon-MikrosatellitÇoğaltılmış Polimorfizmi) ve iPBS (Primer Arası Bağlanma Yeri Polimorfizmi) olarakadlandırılan moleküler belirteçler kullanılarak ulusal birçok çeşidin karakterizasyonuyapılmıştır. Toplamda 211 alel olmak üzere, 3 IRAP primer çifti 49.5 REMAP primer çifti 55ve 7 iPBS primer çifti için 107 alel tespit edilmiştir. Lokus başına ortalama 14 alelbelirlenmiştir. Polimorfik Bilgi İçeriği (PIC) ortalama değeri REMAP için 0.407, IRAP için0.454 ve IPBS için de 0.442 bulunmuştur. Genetik benzerlik değerleri 0.41 ila 0.93 arasındadeğişmiştir. Tüm belirteçler için ortalama fark yöntemi (UPGMA) kümeleme analiziyapılarak, çeşitler genetik benzerliklerine göre gruplandırılmışlardır. Bu çalışmada, fazlasayıda alel ve yüksek PIC değeri vermeleri, ucuz ve kolay elde edinimleri nedeniyle,transposon temelli moleküler belirteçler ile çok yakın ilişkili çeşitlerin dahi ayrımının kolaybir şekilde yapılabileceği görülmüştür. Transposon esaslı belirteçler, çeşitler arasında genetikilişkileri belirlemenin yanı sıra genetik kaynakların korunmasında ve tohum bankalarınınyönetiminde faydalı olabilecektir.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Yr10 gene polymorphism in bread wheat varieties
    (African Journal of Biotechnology, 2008) Temel, A.; Şentürk-Akfırat, F.; Ertuğrul, F.; Yumurtacı, A.; Aydın, Y.; Talas-Oğraş, T.; Gözükırmızı, N.; Bolat, N.; Yorgancılar, Ö.; Belen, S.; Yıldırım, M.; Çakmak, M.; Özdemir, E.; Çetin, L.; Mert, Z.; Sipahi, Hülya; Albustan, S.; Akan, K.; Düşünceli, F.; Altınkut Uncuoğlu, A.
    Yellow rust resistance locus Yr10 located on chromosome 1B in Moro and originated from the Turkish line PI178383 was investigated in terms of polymorphism in seven winter type bread wheat cvs. (Triticum aestivum ssp.Aestivum) Altay2000, İzgi2001, Sönmez2001 (yellow rust resistant), Aytın98, ES14, Harmankaya99 (yellow rust susceptible) and PI178383 as control. Exon 1 (1 - 833 bp) and Exon 2 (1989 - 3630 bp) parts of Yr10 were amplified with three primers. Amplification was not observed with E2A primers in Harmankaya99, İzgi2001 and Sönmez2001 cvs, while amplification products were observable at all tested varieties with the other primers. PCR results showed that E2A reverse primer is not able to anneal to the three varieties mentioned above. Sequence analysis and bioinformatics analysis proved that there has been single nucleotide changes especially in the second exon. The most similar sequences to the first exon of Harmankaya99, İzgi01 and Sönmez2001 are AF509535 (Aegilops tauschiiNBS-LRR-like gene), AF509534 (A. tauschii NBS-LRR-like gene sequence) and AF509534, respectively. These results could be helpful in revealing divergence between resistant and susceptible varieties.