Yazar "Aslan, Yeliz" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • [ X ]
    Öğe
    Ekmeklik buğdayda yeni geliştirilmiş EST kökenli mikrosatellit markırlarının farklı tahıl türleri arasında aktarılması
    (Sinop Üniversitesi, 2018) Aslan, Yeliz; Sipahi, Hülya
    Bu çalışmada, Fusarium enfeksiyon koşulları altında oluşturulmuş buğday EST kütüphanelerinden tasarımlanan mikrosatellit markırlarının türler ve cinsler arası aktarılabilirlikleri, Zea mays, Avena sativa, Hordeum vulgare ile çeşitli Aegilops ve Triticum türlerinde araştırılmıştır. Çalışılan 20 mikrosatellit markırı Triticum türleri içerisinde oldukça yüksek aktarılabilirlik göstermiştir (Triticum turgidum durum subsp durum'da %100, Triticum turgidum durum subsp dicoccon'da %80, Triticum timopheevii subsp timopheevii'de %80, Triticum monoccoccum subsp aegilopoides'de %75, Triticum turgidum durum subsp dicoccoides'de %70, Triticum timopheevii subsp armeniacum'da %85).Ancak aktarılabilirlik oranı diğer tahıllarda nispeten daha düşük bulunmuştur (Avena sativa'da %15, Oryza sativa'da %50, Zea mays'da %45, Hordeum vulgare'de %60).İki mikrosatellit markırı (Contic 578, Contic 1270) test edilen türlerden yalnızca bazı Triticum türlerinde, yine bir diğer iki markır (BE 585853, Conting 267) ise yalnızca Aegilops ve Triticum türlerinde aktarılabilir bulunmuştur. Çalışılan türlerin tümünde aktarılabilir olan sadece bir markır (Conting 556) tespit edilmiştir. Çalışılan tür ve cinslerde buğdaymikrosatellit markırlarının yüksek düzeyde aktarılabilirleri, biyolojik/hücresel/moleküler fonksiyonları olan oldukça korunan genlerin varlığına işaret etmektedir. Aktarılabilirlikleri tespit edilmiş bu mikrosatellit markırları, ilgili tür ve cinslerde Fusarium ile ilişkili aday genlerin haritalanmasında, geniş genetik tabana sahip cinsler ve türler arası hibritlerin tanımlanmasında, karşılaştırmalı haritalama çalışmalarında ve evrimsel ilişkileri tespit etmede kullanılabilirler.
  • [ X ]
    Öğe
    Transferability of barley and wheat EST-microsatellite markers in some Poaceae members
    (Sinop Üniversitesi, 2016) Sipahi, HÜLYA; Aslan, Yeliz; Yumurtaci, Aysen
    The cross species transferability of  barley and wheat microsatellite markersdeveloped from expressed sequence tag (EST) libraries constructed under Fusarium infection conditions were detected among 17 species including 8from Aegilops, 6 from Triticum, Zea mays, Avena sativa, Oryzasativa.Transferability rates of barleymicrosatellite primer pairs ranged from 29% to 100%. A maximum of 100%cross-genera transferability noticed with Avena followed by Zea (92%),Triticum (83%), Aegilops (68%), and Oryza (8%). Primerpairs were highly transferable within species of Triticum (100% in T.turgidum durum durum, 92% in T. turgidum durum dicoccon and T.monococcum aegilopoides, 83% in T.timopheevii timopheevii and T.turgidum dicoccoides, 67% in T. timopheevii armeniacum). Only oneprimer pairs (contig624) showed100 % cross-species/genera amplification in all materials studied. Considering wheat microsatellites, the microsatelliteprimer pairs were highly transferable within species of Triticum (rangedfrom %100 to %70) and but low transferable in the allied cereals (15% inAvena, 50% in Oryza, 45% in Zea, 60% in Hordeum). Twoprimer pairs have shown transferability only in some Triticum species,while two others showed amplication only in species of Aegilops and Triticum.Only one primer pairs showed 100 % cross-species/genera amplification in allmaterials studied.This highercross-species transferability of EST microsatellite markers indicated a highlevel of conservation of DNA sequences belonging to the transcribed region ofthe genome and its suitability in comparative genome mapping, genetic diversityand phylogenetics analysis.