Yazar "Yildirim, Asif" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • [ X ]
    Öğe
    MESANE TÜMÖRLÜ HASTALARIN KANLARINDA EPİGENETİK BİYOBELİRTEÇLER OLARAK PROTOKADERİN GEN AİLESİ ÜYELERİ PCDH8, PCDH10 VE PCDH17’NİN ARAŞTIRILMASI
    (2020) Yeğin, Zeynep; Ozen, Filiz; Koç, Haydar; Yildirim, Asif; Buyukalpelli, Recep
    Amaç: Çalışmanın amacı mesane tümörlü hastalarda vesağlıklı kontrollerde protokaderin gen ailesine ait olanprotokaderin 8 (PCDH8), protokaderin 10 (PCDH10) veprotokaderin 17 (PCDH17) genlerinin periferal kan DNAmetilasyon profillerini analiz ederek bu profillerin tümörspesifikolası etkilerini değerlendirmektir. Araştırılan üçgenin metilasyon profiliyle spesifik demografik ve/veyaklinikopatolojik veriler arasındaki olası ilişkininaraştırılması da çalışmanın ikinci hedefidir.Gereç ve Yöntemler: Mesane karsinomalı (n=80; düşükdereceli: 40, yüksek dereceli: 40) ve sağlıklı kontrollerin(n=40) periferal kan örneklerinden ekstrakte edilen genomikDNA promotor bölgelerinin hipermetilasyon analizi içinbisülfit modifikasyon ve metilasyon-spesifik PCR işleminemaruz bırakılmıştır.Bulgular: PCDH8 metilasyon profilinin yaşla birlikte artışgösterdiği gözlenmiştir. Neredeyse kontrollerin tamamındada bu genler bakımından kısmi metilasyon profilleribelirlendiği için hasta örneklerindeki PCDH10 ve PCDH17metilasyon paternleri bir farklılık oluşturmamakla beraberPCDH8 daha farklı bir kan epigenetik profili sergilemiştir.Sonuç: PCDH8 geninin kandaki metilasyon modelininyaşlanma süreciyle ilişkisi çalışmamızda gösterilmiştir.Mesane kanserindeki etkisi açısından daha kesin bir sonucavarabilmek için PCDH8’in kandaki metilasyon durumunundaha yüksek sayılı kohortta ve MethyLight gibi daha duyarlımetotlarla araştırılmasını tavsiye etmekteyiz.
  • [ X ]
    Öğe
    PER3 VNTR GENOTYPES MAY PREDICT OVERALL SURVIVAL IN BLADDER CANCER PATIENTS IN THE TURKISH POPULATION
    (2020) Yeğin, Zeynep; Ozen, Filiz; Altinisik, Yasin; Yıldırım, Ibrahım Halıl; Yildirim, Asif
    Circadian genes were proven to play significant roles in tumor development and progression via coordinating various cellular processes. Though circadian rhythm disturbances both on the level of expression and genetic variant analysis have been associated with increased risk for many cancer types, none has investigated the potential effect of PER3 VNTR in bladder tumorigenesis yet. In this study, we aimed to assess PER3 VNTR’s effect in terms of creating susceptibility to bladder carcinoma formation. Our second target was to enlighten the possible associations between PER3 genotypes and clinicopathological correlations in bladder carcinoma cohort and thus evaluate outcomes in bladder carcinoma prognosis. In this case-control study, 116 patients and 120 healthy controls were recruited. DNA was isolated from peripheral blood using the standard salting-out procedure and PER3 VNTR variants (ins/del polymorphism) were determined with PCR technique to distinguish the 5-repeats allele (401 bp) from the 4-repeats allele (347 bp). Though this exploratory analysis did not provide evidence supporting the role of PER3 VNTR in the onset of bladder carcinoma, it enabled us to make a risk assessment for the prognosis of bladder carcinoma patients. The survival times of patients decreased in the patient group (progression and cystectomy positive) for PER3 4/4 genotype and (recurrence, progression and cystectomy positive) for PER3 4/5 genotype. Results presented in this study are highly recommended to be investigated and validated in larger samples in different populations and ethnicities to generalize potential clinical utility.