Yazar "Buyukalpelli, Recep" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • [ X ]
    Öğe
    Expression profiles of proto-oncogene TWIST1 and tumor metastasis suppressor gene LASS2 in bladder cancer
    (C M B Assoc, 2018) Yegin, Zeynep; Aydin, Oguz; Koc, Haydar; Buyukalpelli, Recep
    Transcription factor proto-oncogene TWIST1 and tumor metastasis suppressor gene LASS2 have been reported to be involved in various carcinomas but their expression profiles and prognostic significances in bladder cancer are largely unknown. We aimed to determine these genes' expression levels both at mRNA and protein level in bladder cancer. mRNA expression levels of TWIST1 and LASS2 genes were examined using real-time quantitative PCR (qPCR) in human bladder tumors and paired normal adjacent tissues obtained from 44 patients. Protein expression profiles of both genes were detected by immunohistochemical staining in formalin-fixed and paraffin-embedded tissues from the same patients. The expression profiles of TWIST1 mRNA in bladder tumors were significantly lower than the normal adjacent tissues and linked to both the stage and the grade. The expression profiles of LASS2 mRNA in bladder tumors were also significantly lower than the normal adjacent tissues reflecting the potential tumor suppressor profile of the gene, independently from stage or grade. By immunohistochemistry, TWIST1 and LASS2 positive expression rates were found as 14.3% (6/42) and 38.1% (16/42), respectively. As potential molecular markers for bladder carcinoma, both TWIST1 and LASS2 transcripts seem to play role during the tumorigenesis and development of bladder cancer. Lack of a functional link and/or weak inverse link between TWIST1 and LASS2 transcripts and immunohistochemical findings may reflect the potential associations of transcription regulation mechanisms and merit further investigations. To the best of our knowledge, this is the first report investigating the combined expression profile of TWIST1 and LASS2 in bladder cancer both at mRNA and protein level.
  • [ X ]
    Öğe
    Mesane Kanserinde Metastaz Baskılayıcı Gen LASS2 ve Prometastatik Onkogen TWIST1 Ekspresyonlarının Önemi
    (2016) Yeğin, Zeynep; Aydın, Oğuz; Buyukalpelli, Recep
    [No abstract available]
  • [ X ]
    Öğe
    MESANE TÜMÖRLÜ HASTALARIN KANLARINDA EPİGENETİK BİYOBELİRTEÇLER OLARAK PROTOKADERİN GEN AİLESİ ÜYELERİ PCDH8, PCDH10 VE PCDH17’NİN ARAŞTIRILMASI
    (2020) Yeğin, Zeynep; Ozen, Filiz; Koç, Haydar; Yildirim, Asif; Buyukalpelli, Recep
    Amaç: Çalışmanın amacı mesane tümörlü hastalarda vesağlıklı kontrollerde protokaderin gen ailesine ait olanprotokaderin 8 (PCDH8), protokaderin 10 (PCDH10) veprotokaderin 17 (PCDH17) genlerinin periferal kan DNAmetilasyon profillerini analiz ederek bu profillerin tümörspesifikolası etkilerini değerlendirmektir. Araştırılan üçgenin metilasyon profiliyle spesifik demografik ve/veyaklinikopatolojik veriler arasındaki olası ilişkininaraştırılması da çalışmanın ikinci hedefidir.Gereç ve Yöntemler: Mesane karsinomalı (n=80; düşükdereceli: 40, yüksek dereceli: 40) ve sağlıklı kontrollerin(n=40) periferal kan örneklerinden ekstrakte edilen genomikDNA promotor bölgelerinin hipermetilasyon analizi içinbisülfit modifikasyon ve metilasyon-spesifik PCR işleminemaruz bırakılmıştır.Bulgular: PCDH8 metilasyon profilinin yaşla birlikte artışgösterdiği gözlenmiştir. Neredeyse kontrollerin tamamındada bu genler bakımından kısmi metilasyon profilleribelirlendiği için hasta örneklerindeki PCDH10 ve PCDH17metilasyon paternleri bir farklılık oluşturmamakla beraberPCDH8 daha farklı bir kan epigenetik profili sergilemiştir.Sonuç: PCDH8 geninin kandaki metilasyon modelininyaşlanma süreciyle ilişkisi çalışmamızda gösterilmiştir.Mesane kanserindeki etkisi açısından daha kesin bir sonucavarabilmek için PCDH8’in kandaki metilasyon durumunundaha yüksek sayılı kohortta ve MethyLight gibi daha duyarlımetotlarla araştırılmasını tavsiye etmekteyiz.