Yazar "Ağar, Ayşen Alaman" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Juloliden Bazlı Schiff Bazı İçeren Bileşiğin Sentezi, Kristalografik Yapısı, DFT Hesaplamaları, Hirshfeld Yüzey Analizi, İlaç Benzerliği ve Moleküler Yerleştirme Üzerine Bir Çalışma
    (2025) Meral, Seher; Ağar, Ayşen Alaman; Ersanlı, Cem Cuneyt; Erdoğan, Yasin
    Bu çalışma, juloliden bazlı bir molekülün (C36H50N4O2) moleküler yapısının derinlemesine bir incelemesini sunmaktadır. Araştırma X-ışını kırınımı, yoğunluk fonksiyonel teorisi hesaplamaları, Hirshfeld yüzey analizi, ilaç benzerliği değerlendirmesi ve moleküler yerleştirme simülasyonlarını içermektedir. Bileşiğin yapısı ilk olarak X-ışını koordinatlarından türetilmiş ve daha sonra 6-31G(d,p) ve 6-311G(d,p) temel setleri ile B3LYP yoğunluk fonksiyonel teorisi yöntemi kullanılarak optimize edilmiştir. Bu makalede, bu molekülün ayrıntılı moleküler etkileşimleri ve X-ışını kristal yapısı tartışılmaktadır. Uzay grubu 𝑃1̅ ve aşağıdaki birim hücre parametrelerine sahiptir: a = 6.8512 (9) Å, b = 9.9748 (14) Å, c = 13.892(3) Å, α = 74.679 (13)o, β = 86.608 (13)o, γ = 75.049 (11)o, V = 884.6 (2) Å3, Z = 1. Juloliden bazlı bileşik, ters simetriye sahip asimetrik birimdeki molekülün sadece yarısı ile kristalize edilmiştir. O–H···N ve C–H···O hidrojen bağları ve C–H···π etkileşimlerinden oluşan karmaşık bir ağ, kristal yapıyı stabilize ederek supramoleküler mimariler oluşturur. Sentezlenen bileşiğin teorik parametreleri deneysel bulgularla karşılaştırılmıştır. Optimize edilmiş yapı, sınır moleküler orbital analizi, moleküler elektrostatik potansiyel ve kimyasal reaktivite indekslerini kapsayan aynı teorik düzeyde analiz edilmiştir. Moleküler etkileşimleri tahmin etmek için Hirshfeld yüzey değerlendirmesi kullanılmıştır. Buna ek olarak, ilaç benzerliği çalışması şema üzerinde gerçekleştirilmiştir.
  • [ X ]
    Öğe
    Sentezlenen Yeni Ni (II) Komplekslerinin Spektroskopik ve antifungal özelliklerinin İncelenmesi
    (2020) Karakurt, Tuncay; Meral, Seher; Ağar, Ayşen Alaman; Onaran, Abdurrahman
    Bu çalışmada, 6,6'-((1E,1'E)-(propan-1,3 diilbis(azanildien))bis(fenillmetanildien))bis(3-(oktiloks)fenol) (HL1)ve 6,6’-((1E,1’E)-(etan-1,2-diilbis(azanildien))bis(fenillmetanildien))bis(3-(oktiloks)fenol) (HL2) ligandları ile Ni metal atomunun iki farklı kompleksi (HL1Ni ve HL2Ni ) sentezlendi ve NMR, FT–IR ve UV–Vis spektroskopik yöntemleri ile karakterize edildi. İki kompleks yapının in vitro koşullar altında Rhizoctonia solanive Fusarim oxysporum f.sp radicis–lycopersici (FORL) bitki patojenlerine karşı antifungal aktivite çalışmaları yapıldı. Etkinliği belirlenen bileşiklerin doz miktarına göre test edilen patojenlere karşı orta ve yüksek düzeyde aktivite sergilediği belirlendi. Ayrıca Kompleks yapıların moleküller arası etkileşimlerin daha iyi anlaşılabilmesi amacıyla da bileşiklerin HOMO–LUMO orbitalleri teoriksel olarak elde edildi. Son olarak da moleküler doking çalışması ile reseptör–kompleks etkileşimleri simüle edildi. Bu hesaplama sonucunda komplekslere ait afinitedeğerleri (Doking skoru) sırasıyla -6.9 ve -6.4 kcal/mol olarak hesaplandı. Kompleks yapıların doking skorları ile HOMO orbital enerjilerinin birbirleriyle ilişki olduğu gözlendi