Yazar "Öztürk, Filiz" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 5 / 5
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Bakır(II)–Sulfametazin-2,2'-bipiridin Kompleksinin Hesaplamalı Kimya Yöntemi ile Spektroskopik Özelliklerinin İncelenmesi: Moleküler Modelleme Çalışması, ADME/T(2023) Öztürk, Filiz; Aycan, Tugba[Cu(smz)2bipy] kompleksinin teorik hesaplamaları DFT (Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi) yöntemi ile B3LYP ve LanL2DZ baz seti kullanılarak hesaplanmıştır. Hesaplamalar sonucunda elde edilen değerler, deneysel yapının geometrik parametreleri ile oldukça uyumludur. Bununla birlikte sulfamethazin ligantının DFT/B3LYP/6-311G baz seti kullanılarak hesaplanmıştır ve sonuçlar kompleks yapı ile karşılaştırılmıştır. Kompleks optimize edildikten sonra EHOMO ve ELUMO değerleri saptanmıştır. Sınır Moleküler Orbitalleri (FMOs) ile kompleks ve serbest ligant (Hsmz)’nin kimyasal ve biyolojik aktiviteleri karşılaştırılmıştır. Mulliken popülasyon analizi, MEP (Moleküler Elektrostatik Potansiyel) ve MEP kontör gösterimi ile kompleksin elektrofilik ve nükleofilik bölgeleri belirlenmiştir. Kompleksin ve Hsmz ligantının deneysel IR (Infrared) sonuçları teorik olarak elde edilen değerler ile karşılaştırılmıştır. Hirshfeld yüzey analizi yöntemi ile moleküller arası etkileşimleri ayrıntılı incelenmiştir. Ayrıca E. coli bakterisi üzerinde olumlu sonuçlar verdiği dikkate alınarak PDB (Protein Data Bank)’dan Giraz Tip IIA Topoisomeraz ve DNA Giraz enzimleri indirilerek moleküler kenetleme çalışması yapılmıştır. Kompleks, in-silico yöntem ile ADME/T özellikleri incelenerek ilaç özelliği taşıyıp taşımadığı tartışılmıştır.Öğe Çinko(II)–Sulfatiyazol-Dietilentriamin Kompleksinin Hesaplamalı Kimya Yöntemi ile Spektroskopik Özelliklerinin İncelenmesi: Moleküler Modelleme Çalışması(2021) Öztürk, Filiz; Aycan, TugbaX-ışını kırınım deneyi ve spektroskopik özellikleri incelenen yapının kuramsal hesaplamaları DFT, B3LYPve LanL2DZ baz seti kullanılarak hesaplanmıştır. Optimize yapının ve X-ışını kırınımı sonucunda eldedilen deneysel yapının geometrik parametreleri oldukça uyumludur. Sulfatiyazol ligantı iseDFT/B3LYP/6-311G baz seti kullanılarak hesaplanmıştır. Kompleksin en kararlı hali elde edildikten sonraHOMO ve LUMO enerjilerinden lokal ve global kimyasal aktiviteleri belirlenmiştir. Moleküller arasıetkileşimlerin % katkısı, parmak izi tayini ve toplam yüzey haritaları Hirshfeld yüzey analizi yöntemi ileincelenmiştir. Öncü moleküler orbitaller olan HOMO ve LUMO enerjileri kullanılarak hesaplanan sertlikve yumuşaklık parametreleri ile global kimyasal aktiviteleri belirlenmiştir ve Mulliken popülasyon analizive moleküler elektrostatik potansiyel ile lokal kimyasal aktivite verileri elde edilmiştir. Böylece yapınınelektrofilik ve nükleofilik indeksi belirlenmektedir. Ayrıca daha önce Öztürk tarafından sentezlenen Znstz komleksin teorik IR değerleri deneysel sonuçları ile karşılaştırılmıştır.Öğe Investigation of Structural, Spectral, Biological Activity of Monohydrous Dihydrogen Phosphate Salt of Ciprofloxacin: Computational and Molecular Docking Study(2020) Aycan, Tugba; Öztürk, Filiz; Ozdemir, Nilgun; Pasaoglu, HümeyraThe present study describes the synthesis, spectroscopic and biological activity of Monohydrous Dihydrogen Phosphate Salt of Ciproflox-acin (MDPSC). The asymmetrical part of the unit cell contains one ciprofloxacin cation, one dihydrogen phosphate anion and one water molecule. The techniques used for the characterization are single crystal X-ray diffraction and spectroscopic method (IR, UV) and thermal analysis. The molecular structure was theoretically optimized using DFT/B3LYP/6-31G(d,p) methods for ground state, and compared with experimental values. Scaled theoretical vibrational frequencies are compared with experimental values. The UV-Vis results that experimen-tally obtained are compared with the calculated electronic properties such as HOMO and LUMO energies and the MEP are also investi-gated. The vibrational frequences has been studied by comparing the characteristic bands related to the functional groups of the compound and the ciprofloxacin. Thermal properties have been investigated with TGA. Biological study of the complex against Staphylococcus aer-ous, Escherichia coli, Candida Albicans, Bacillus Subtilis, Pseudomonas aeruginosa and Aspergillus Flavus showed very strong antibac-terial activity with MIC values ranging from 512 μg mL-1 to 1 μg mL-1. The optimized complex is docked to the 5J9B, 5BMM, 5HTG, 1ZUV, 4F0V and 4YNU.Öğe Sülfametiyazol-2,2'-Bipiridin Tuzunun Yapisal ve Spektral Incelenmesi: Deneysel ve Moleküler Modelleme Çalismasi(Bitlis Eren Üniversitesi, 2020) Öztürk, Filiz; Aycan, Tugba; Çon, Ahmet HilmiBu çalismada Sülfametiyazol-2,2'-Bipiridin tuzununsentezi, spektroskopik özellikleri (IR, UV-Vis ve termal) açiklanmaktadir.Birim hücrenin asimetrik biriminde, bir sülfametiyazol, bir 2,2'-Bipiridiniçermektedir. Karakterizasyon için tek kristal X-isini kirinimi teknigikullanilmistir. 296 K' de tek kristal X-isini kirinimi sonucuna göre P21/n monoklinik uzay grubunda a = 8.658 (3) Å, b =24.686 (6) Å, c = 9.927 (4) Å, a = 90º, ß = 103.61 (3)º, ? = 90º ve Z = 4 olarakkristallendigi görülmüstür. Molekül üzerine kapsamli olarak teorik ve deneyselyapisal çalismalar FT-IR ve UV-Vis spektroskopisi ile yapilmistir. Teorikhesaplamalar ve optimize edilmis geometrik parametrelerin tümü, yogunlukfonksiyonel teorisi (DFT), B3LYP hibrit yöntemi 6-31G (d,p) baz setikullanilarak hesaplanmistir. TGA ile termal özellikler incelenmistir. KompleksinStaphylococcus aureus, Bacillus subtilis,Escherichia coli, Pseudomonasaeruginosa, Candida albicans ve Aspergillus flavus’a karsiantimikrobiyal çalismalari yapilmistir. Optimize edilmis kompleks, 5J9B, 5BMM,5HTG, 1ZUV, 4F0V ve 4YNU’ya yerlestirilerek biyolojik aktivitesi teorik olarakincelenmistir.Öğe Sülfametiyazol-2,2′-Bipiridin Tuzunun Yapısal ve Spektral İncelenmesi: Deneysel ve Moleküler Modelleme Çalışması(2020) Öztürk, Filiz; Aycan, Tugba; Çon, Ahmet HilmiBu çalışmada sülfametiyazol-2,2′-bipiridin tuzunun sentezi, spektroskopik özellikleri (IR, UV-Vis ve termal)açıklanmaktadır. Birim hücrenin asimetrik biriminde, bir sülfametiyazol, bir 2,2′-bipiridin içermektedir.Karakterizasyon için tek kristal X-ışını kırınımı tekniği kullanılmıştır. 296 K' de tek kristal X-ışını kırınımısonucuna göre P21/n monoklinik uzay grubunda a = 8.658 (3) Å, b = 24.686 (6) Å, c = 9.927 (4) Å, α = 90º, β =103.61 (3)º, γ = 90º ve Z = 4 olarak kristallendiği görülmüştür. Molekülün FT-IR ve UV-Vis spektroskopileriteorik ve deneysel olarak karşılaştırılmıştır. Teorik hesaplamalar ve optimize edilmiş geometrik parametrelerintümü, yoğunluk fonksiyonel teorisi (DFT), B3LYP hibrit yöntemi 6-31G (d,p) baz seti kullanılarak hesaplanmıştır.TGA ile termal özellikler incelenmiştir. Kompleksin Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Escherichia coli,Pseudomonas aeruginosa, Candida albicans ve Aspergillus flavus’a karşı antimikrobiyal çalışmaları yapılmıştır.Optimize edilmiş kompleks, 5J9B, 5BMM, 5HTG, 1ZUV, 4F0V ve 4YNU’ya yerleştirilerek biyolojik aktivitesiteorik olarak incelenmiştir.
